Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP2B3Q16720 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms