Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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