Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JMJD1CQ15652 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms