Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRCAPQ14761 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms