Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FAM53BQ14153 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FAM53BQ14153 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM53BQ14153 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM53BQ14153 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM53BQ14153 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM53BQ14153 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM53BQ14153 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM53BQ14153 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM53BQ14153 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FAM53BQ14153 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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