Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms