Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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