Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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