Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms