Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL360169.2-201ENST00000619713 561 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LMNTD1-203ENST00000445693 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 LINC00564-201ENST00000567258 1119 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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MKRN4PQ13434 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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