Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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