Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GRHL3-203ENST00000356046 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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UBE2V1Q13404 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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UBE2V1Q13404 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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