Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CBX3Q13185 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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