Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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