Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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