Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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