Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms