Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms