Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms