Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SRSF4Q08170 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms