Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms