Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ACAT1-202ENST00000299355 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC009075.2-201ENST00000568483 301 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZNF761-205ENST00000613950 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZNF365-211ENST00000614806 877 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms