Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms