Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREMQ03060 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREMQ03060 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CREMQ03060 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREMQ03060 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREMQ03060 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREMQ03060 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREMQ03060 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms