Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms