Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms