Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD3P84022 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms