Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRX1P78414 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms