Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms