Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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