Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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