Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MTCP1P56278 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms