Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms