Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms