Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC11A1P49279 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms