Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NESP48681 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NESP48681 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NESP48681 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms