Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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