Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGIRP43119 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms