Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GGCXP38435 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms