Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms