Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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