Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SDSP20132 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDSP20132 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDSP20132 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms