Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFE3P19532 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms