Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms