Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms