Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOP2AP11388 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP2AP11388 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms