Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CD28P10747 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CD28P10747 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CD28P10747 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CD28P10747 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CD28P10747 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms