Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOEP02649 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOEP02649 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOEP02649 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms