Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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