Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINC1P01008 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms